Минералогический музей им. И.К. Баженова Томского государственного университета основан в 1888 году. Его фонды насчитывают более 30 тысяч образцов, представляющих 700 видов и разновидностей царства минералов.
Пополнение музейного собрания осуществлялось преподавателями и студентами университета на месторождениях Урала, Алтая, Саян, Кузнецкого Алатау, Восточного и Западного Танну-Ола, Монголии, Забайкалья, Приморья, Кольского полуострова, Якутии и др. Нередко образцы и изделия из минералов передают в дар музею выпускники геолого-географического факультета ТГУ.
Гордостью музея являются коллекции, собранные в конце XIX – начале XX века известными учеными, инженерами и золотопромышленниками А.М. Зайцевым, З.М. Цибульским, П.П. Пилипенко, П.П. Ивановым и др.