Музей ИМБТ СО РАН («Музей научного наследия) существует с 1969 г. В настоящее время в музее хранится более 3000 предметов по различным направлениям научной деятельности: археология, геология, палеонтология, биология; ведется планомерная и целенаправленная собирательская работа. С 2010 года началось комплектование коллекции научных приборов; коллекции фотодокументов по истории становления и развития научных исследований в Бурятии.  К коллекциям Музея ежегодно обращаются российские и зарубежные исследователи – археологи, антропологи, палеонтологи, генетики. Музей ИМБТ СО РАН является членом Международной Ассоциации естественноисторических музеев и членом Союза Музеев России.
Действуют пять постоянных экспозиций. Их основу составляют результаты научных исследований бурятских ученых.
Основные направления научной деятельности музея: история развития науки в Бурятии; естественноисторическое развитие региона; взаимодействие человека и природы, этногенез и культурогенез народов Центральной Азии; музейная педагогика; теория музейного дела; менеджмент и маркетинг в музеях.