Музей геологии докембрия основан 18 мая 1961г., как самостоятельное подразделение в структуре Института геологии. Первым заведующим был Юдин Виктор Николаевич. Основой музейной коллекции послужили полевые образцы геологов института и других организаций работающих на территории Карелии. В настоящее время фонд музея составляет более 3500 единиц хранения и музейная экспозиция развернута в двух залах. В нижнем зале представлена экспозиция по трем разделам: рельеф и четвертичные отложения Карелии, минералогия и строматолиты Карелии и мира (данный раздел представлен уникальной коллекцией и не имеет аналогов в других музеях). В верхнем зале экспозиция посвящена основным вопросам геологии, металлогении и минерагении В.Фенноскандии.