Музей истории академической науки Якутии имени Г.П. Башарина был открыт в Институте в 2002 году согласно Постановлению Правительства РС(Я) «Об увековечении памяти профессора Г.П. Башарина» от 26 мая 1992 года. Цель создания музея сбор, сохранение, изучение и популяризация информации об академической науке в Якутии, начиная с первых экспедиций Российской академии наук в XVIII веке, и заканчивая современностью академической науки республики.
Музей ставит своей задачей отразить историю развития, преемственность поколений, основные достижения и жизнь выдающихся деятелей науки. История якутской науки является неотъемлемой частью историко-культурного наследия Якутии. С момента создания в 1724 году Петром Великим отечественной Академии наук, судьба Якутского края неразрывно связана с наукой. Многие интереснейшие события и явления истории Якутии связаны с деятельностью ученых-исследователей: членов экспедиций, путешественников, политических ссыльных, местных краеведов и просветителей, работников научных учреждений.
В залах музея представлены материа лы об экспедициях Российской академии наук в Якутии, создании и работе собственных научных учреждений республики. Также музей собирает и экспонирует материалы об участии коренного населения Якутии в дореволюционных научных экспедициях Российской академии наук.
Отдельный большой раздел экспозиции посвящен истории Института гуманитарных исследований и проблем малочисленных народов Севера СО РАН - первого в Якутии научно-исследовательского учреждения. Институт был организован в 1935 году как Институт языка и культуры при Совнаркоме ЯАССР. В третьем зале представлено современная наука Якутии - научные подразделения ФИЦ ЯНЦ СО РАН.