Археологический музей ИвГУ существует с 1992 года. Именно тогда университету были переданы коллекции Верхневолжской экспедиции Института археологии РАН. Основу фондов музея составили находки руководителя экспедиции – профессора Дмитрия Александровича Крайного. Ежегодно музей пополняется новыми находками из раскопок археологических памятников Верхневолжья (коллекции М.Г. Жилина, А.В. Уткина, Е.Л. Костылевой, П.Н. Травкина). К настоящему времени фонды музея насчитывают более 50 тысяч экспонатов. Археологические находки отражают древнейшую историю центра Русской равнины от 8-го до 1-го тысячелетия до н.э., т.е. эпохи камня и раннего металла. Наряду с массовыми материалами, орудиями труда, украшениями, здесь представлены уникальные образцы древнего искусства: костяные, каменные, глиняные и деревянные фигурки птиц, животных, людей, орнаментированные изделия.
Экспозиция музея предназначена, прежде всего, для учебных целей и широко  используется  для занятий по археологии и истории культуры.