Музей "Археология, этнография и экология Сибири" основан при Кемеровском государственном университете в 1976 г.
Уникальные коллекции, представленные в музее, формировались сотрудниками университета под руководством заведующего кафедрой археологии А. И. Мартынова и заведующей кафедрой зоологии Т. Н. Гагиной с 1976 года и ежегодно пополняются новыми материалами.
Музей КемГУ – крупнейший вузовский музей региона. Он возглавляет научно-методический совет вузовских музеев Кузбасса, входит в Ассоциацию естественно-исторических музеев России, Совет исторических и краеведческих музеев Сибири, Межрегиональную сибирскую ассоциацию исследователей первобытного искусства.
Музей включает в себя экспозиционные залы, библиотеку, фототеку, архив,  камеральную лабораторию, фондохранилища.
Коллекции музея представляют материальную и духовную культуру населения Кузнецкого края и других районов Южной Сибири в разные исторические периоды, а также природное разнообразие региона и сопредельных территорий.
Экспозиция музея состоит из 4-х отделов: археологии, этнографии, природы и экологии, истории вуза. Фонды музея насчитывают более 310 000 единиц хранения.
Структура построения экспозиции способствует образному восприятию истории с древнейших времен до современности; позволяет проследить использование человеком природных ресурсов, возрастание антропогенного воздействия на природу. в отделе истории вуза собраны уникальные коллекции по становлению высшего образования в Кузбассе и подготовке педагогических кадров в регионе.